إنشاء المقصورة الكبرى داخل الحرم من قبل الخليفة سليمان بن عبد الملك , وهي عبارة عن غرفة واسعة ذات سياج خشبي مخصصة لصلاة الخليفة وضيوفة, وسميت أيضاً بمقصورة الخطابة.

إنشاء قبة المال داخل صحن الجامع بأمر من الوالي الفضل بن صالح في عهد الخليفة العباسي المهدي.

نشب صراع ما بين الناس وسلطة الدولة الفاطمية بدمشق نتج عنه احتراق قصر الخضراء قرب الجامع وامتداد النيران لتشمل الجامع الأموي الذي لم يبقى منه سوى الجدران بعد أن سقطت الفسيفساء منها.
تم جمع الفسيفساء ووضعه ضمن المشاهد (قاعات داخل المسجد).

إعادة بناء الأسقف وقبة النسر والأجزاء الداخلية من المسجد من قبل الوزير الحسن بن الطوسي الملقب بنظام المُلك في عهد السلطان السلجوقي تاج الدولة تتش التابع شكلياً للخليفة العباسي المقتدي بأمر الله, ولم تشمل الإصلاحات صحن الجامع الذي بقي من الطين والتراب.

تم تجديد بناء الحائط لشمالي للجامع بأمر من الأتابك أبو المنصور طغتكين   (مؤسس دولة أتابكة الشام ) والتابع شكلياً للخليفة العباسي المستظهر بالله.

إصلاح أجزاء من الفسيفساء بإشراف قاضي القضاة بدمشق كمال الدين الشهرزوري وبأمر من السلطان نور الدين زنكي ( الشهيد ) التابع شكلياً للخلافة العباسية.

شب حريق في حي اللبادين ( النوفرة حالياً ) وامتدد للقسم الشرقي من الجامع الأموي.

نشب حريق من مدرسة الكلاسة وامتدد ليشمل المئذنة الشمالية للجامع الأموي ( مئذنة العروس ) .

بدء عملية إعادة تبليط صحن الجامع وأرض الحرم بأمر من السلطان الأيوبي الملك العادل سيف الدين أبي بكر ( أخو السلطان صلاح الدين الأيوبي ) والتابع شكلياً  للخلافة العباسية.

من642هـ/1245م ولغاية 668هـ/1269م تقريباً
تحول الجامع لما يشبه الخان أو المستودع فكل شخص يضع لنفسه مقصورة أو خزانة داخل صحن الجامع وينام فيه أو يجعل تجارته ومقامه داخل المسجد.

قام الملك الظاهر بيبرس بإزالة كافة الإشغالات داخل الجامع وإعادة فرشه بما يليق به, وإجراء عدد من الإصلاحات على الرخام والفسيفساء.

شب حريق في حي اللبادين ( النوفرة حالياً ) وامتدد لأجزاء من جدار الجامع وسقفه الشرقي.

إصلاحات شاملة للجدران القسم الداخلي من الجامع بأمر نائب دمشق الأمير سيف الدين تنكز وفي عهد السلطان المملوكي محمد بن قلاوون.

اندلع في دمشق حريق هائل دمر أجزاءً كبيرةً منها وأتى على القسم الشرقي من الجامع الأموي.

إصلاحات في صحن الجامع وتنظيف مقصورة الخطابة وقبة النسر وإعادة فرش الجامع وإنارته.

التتار بقيادة تيمورلنك يغزون دمشق ويضرمون النار في المدينة وفي الجامع الأموي الذي لم يبقى منه سوى الجدران.

بدء عملية إعادة بناء الجامع بعد كارثة تيمورلنك, وتوقف الصلاة فيه لعدة سنوات.

إصلاح المئذنة الغربية وتصفيح أبواب الجامع بأمر وإشراف من السلطان المملوكي المؤيد شيخ المحمودي.

إعادة بناء المئذنة الغربية ( مئذنة قايتباي ) بأمر من السلطان المملوكي قايتباي.

عدة زلازل في دمشق أدت لهدم الجدارين الشمالي والشرقي من الجامع وسقوط المئذنة الشرقية وقبة النسر وسقف الممر الشمالي من الجامع.

ترميم بركة الصحن بأمر من الوالي العثماني عثمان باشا

حريق هائل استمر لمدة ساعتين ونصف أدى لخراب كبير ودمار معظم أجزاء وسقوف الجامع .    ( لمعلومات إضافية )

بدء عملية إصلاح كبيرة للجامع بأمر من الوالي ناظم باشا وفي عهد السلطان العثماني عبد الحميد الثاني.    ( لمعلومات إضافية )

ترميم قبة الساعات داخل صحن الجامع وإزالة الجدران الدخيلة التي أنشئت عام 1818م.

بدء عملية إعادة تجميع وتركيب الفسيفساء في أمكنتها الأصلية بعد سنوات من الدراسات والتجارب لصنيع كميات إضافية من الفسيفساء حسب المواصفات التاريخية الأصلية بدلاً من الكميات المفقودة.

أزيلت القبة الموجودة فوق بركة الصحن بهدف إنشاء بركة واسعة لكن الفكرة ألغيت حرصاً على عدم تغيير المعالم التاريخية للجامع.

انتهاء عملية إعادة تركيب الفسيفساء في واجهة الحرم وأنحاء أخرى من المسجد, إضافة لقبة المال (لأول مرة) بإشراف مديرية أوقاف دمشق ومديرية الآثار والمتاحف.

السيد الرئيس حافظ الأسد يشكل لجنة لإصلاح وتطوير الجامع الأموي  مهمتها الإشراف على إعادة ترميم الجامع ترميماً شاملاً. 
( لمعلومات إضافية )

انتهاء عمليات ترميم الجامع وإعادة افتتاحه من قبل الرئيس الراحل حافظ الأسد.   ( لمعلومات إضافية )